Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms