Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP99D6REC4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms