Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF879B4DU55 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF879B4DU55 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms