Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DEV8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DEV8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DEV8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DEV8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DEV8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DEV8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DEV8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DEV8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DEV8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DEV8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DEV8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DEV8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DEV8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms