Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP17L5A8MUK1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP17L5A8MUK1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L5A8MUK1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms