Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8B2A6NJW9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms