Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM247A6NEH6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms