Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX2A2RU54 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX2A2RU54 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms