Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC78A2IDD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC78A2IDD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.4 ms