Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBC2A0A5B9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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