Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCRBV5S2A0A599 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCRBV5S2A0A599 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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