Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0U1RQF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0U1RQF3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms