Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVW-1Q9UQF0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms