Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms