Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms