Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms