Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms