Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms