Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNMT3BQ9UBC3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms