Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

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Length 75 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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