Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL28Q9NXS3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
KLHL28Q9NXS3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms