Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms