Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP29Q9HBJ7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP29Q9HBJ7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP29Q9HBJ7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP29Q9HBJ7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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