Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms