Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1BQ9BZX4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms