Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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LRRC3Q9BY71 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRRC3Q9BY71 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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