Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms