Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms