Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
YIPF4Q9BSR8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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