Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms