Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms