Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS3Q8IXF0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms