Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CNTN4Q8IWV2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN4Q8IWV2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms