Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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USP31Q70CQ4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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USP31Q70CQ4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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USP31Q70CQ4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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USP31Q70CQ4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP31Q70CQ4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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