Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms