Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDF6Q6KF10 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDF6Q6KF10 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms