Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SAMD13Q5VXD3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SAMD13Q5VXD3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SAMD13Q5VXD3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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