Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms