Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms