Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBAP2Q5T6F2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms