Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRMS1LQ5PSV4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms