Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms