Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC38Q502W7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms