Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP28Q4G0W2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms