Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms