Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FXNQ16595 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FXNQ16595 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FXNQ16595 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FXNQ16595 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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FXNQ16595 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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FXNQ16595 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FXNQ16595 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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