Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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