Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK7Q16549 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms