Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC37Q16543 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms