Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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